BAC hybridization for KAT, Profilin, GP39, PF24 and GP359 probes, linkage group X

This table contains molecular mapping data from the Silflow-Lefebvre laboratory at the University of Minnesota.
The contigs consist of BamHI/HindIII fragments. Initially these were unordered, but in some cases we have been able to order them based on the genomic sequence. In the map below, the highlighted fragments have been ordered based on the sequence of v1.0 scaffold 25.

                KAT                   Profilin         GP359                  
Frag.sizes(kb) 7.9 0.9 10.2 2.0 3.9 6.7 12.1 4.8 3.5 3.7 0.6 4.5 1.9 3.1 2.3 2.6 8.1 2.0 2.4 1.1 1.0 1.5 8.6 0.7 14 10.5 5.0 3.8 6.8 11 5.3 3.3
BACs                                                                
10a2         x x x x x x x x x x x x x x x x x x x                  
20m15                   x x x x x x x x x x x x x                    
33d4               x x x x x x x x x x x x                          
35m18           x x x x x x x x x x x x x x x x x                    
37p5                               x x x x x x                      
39b18               x x x x x x x x x x x x x x x x                  
6m18 x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x                    
33i14 x x x x x x x x x                                              
27d3         x x x x x                                              
7f10                                             x                  
17f13                                               x x x x x x x x x
19o6                                         x x x x x              
14e9                                               x x x            
4c8                                         x x x                  
31e8                                               x x x x x x x x x
28o6                                               x x x x x x x x x
30g8                                         x x x x x x x x x      
 

156 kb contig


Last updated on October 11, 2004
by Nancy Haas nancy-h@cbs.umn.edu

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