Linkage Group VI

This table contains molecular mapping data from the Silflow-Lefebvre laboratory at the University of Minnesota.
Asterisks denote BAC clones at the end of a contig.

LG        PROBE        ACCESSION # v2.0 SCAFFOLD v1.0 SCAFFOLD CONTIG SIZE OVERLAP WITH SCREENED BY BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC
VI MT AF399653 193, 691 3936 (see note below)   Ferris/Goodenough     10n20 11c13 11h12                 (12h6)   13c19       15l14   16c23 16h22   17b14   18b16   18k18 18n16 18p21   1i1     20f17   20l2   20p1 21a4 (21c5)     21e12               22i5         (22m24) 23c16       24a11       (24d16)   24f7       24k9 25f23 25i16 25j4             26j18       27h1         28d17     29d18             2f4     2m17 2n21     30p21 30p22   31e10 31h18 32f19     32k2         33d13   33i24 33j2       33o13 33o16       35j12             (37g17)     37m14 (38c9)             39c21         39l13             4h3     4j21 4n18   5c15   5e21         6n12 7d15       9b20 9l19
VI HSP70B X96502 75 211 124 kb HSP70B contig (124 kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                                                       24e16                                                                                                       33b20                                       36o11*           38c23                                                                          
VI RPL7a BI528445 75 1010   HSP70B contig (124 kb) Silflow/Lefebvre           11i3                       14d15*                                                                                                                                                                                                           33b20                                       36o11                                                                                      
VI EST 925005B02 BE441377 75 1010   HSP70B contig (124 kb) Silflow/Lefebvre           11i3                       14d15                                                                                                                                                                                                           33b20                                       36o11                                                                                      
VI TPX AF312025 20 194 143 kb TPX contig (143 kb) L.Keller                 12d19*                                                   20c3                     21j17                           23c21                                                         27m18 27n19                                                                                                                 38e3                           40l3                                     8o1*      
VI EST925004G12 BE441360 20 194   TPX contig (143 kb) Silflow/Lefebvre                 12d19*                                                   20c3                     21j17                           23c21                                                                                                                                                                             38e3                           40l3                                     8o1      
VI FA1 AF246990 20 194   TPX contig (143 kb) Silflow/Lefebvre                 12d19*                                                 1l13                                                   23c21                                                         27m18         28p11           2d4                                                                                             38e3                           40l3                                            
VI EST925020B06 BE442424 20 194   TPX contig (143 kb) Silflow/Lefebvre                 12d19*                                                 1l13                                                   23c21                                                         27m18 27n19       28p11           2d4                                                                                                             39h15           40l3                       6f19                    
VI ATPC J04219 20 73 93 kb   Silflow/Lefebvre                   12e4     12i19                             18e24                                                                   23m10*                             25j8                                     29e3*                                                           34h20   34n10               36f2                                                                             6i13                
VI DHC3 U61366 27 99 76 kb   Silflow/Lefebvre                                               16l22                                                     22f10                                                                                               2b6*                                                                   35e21*                                                                                                    
VI CNA80 BI816487 27 1636 125 kb   Silflow/Lefebvre                                     14i9*             17i9                                               22d14*                                                                                                                                                                                                                                                                          
VI CNA46       58 kb CNA46 contig (58 kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                       22f16   22i21                                                                         27o17                                                                       34m8                       36n21*                                               4g11           5b20                       9b8    
VI RPS18 AW661088 27 488   CNA46 contig (58 kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                       22f16   22i21                                                                         27o17                                                                       34m8                       36n21*                                               4g11           5b20                       9b8    
VI S813 X53574 43 1312 88 kb   Silflow/Lefebvre                                         15o19*                               20j24           21c18 21e11     21j24*   22d3               22k20                             24j13                       26p15       27m2                                             31e9         32i14                                                                     39a19     39f16   39j23   39p3               4i7                                  
VI CNC30 M24072 29 1191 94 kb CNC30 contig (94 kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                         2d19     2k15*                                 33c16                                                         39a9     39e7*                                                            
VI EST 925003F02 BE441254 29 335   CNC30 contig (94 kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                 29j17       2d19                                 32k12     33c16                                 36h5                       39a9     39e7                       4h16                                    
VI PF14 X14549 29 105 89 kb   Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                             2f18                                                                                                                                       5d14     6l2                  
VI PBT201       148 kb PBT201 contig (148 kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                                                                                             36c1                                                     4e18*                           6m15     8h11*        
VI ICL U18765 146 497   PBT201 contig (148 kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                                                                                             36c1                                                     4e18                           6m15     8h11        
VI CABI-1 X65119 146 497     Silflow/Lefebvre none                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
VI PP1 AF156101 226 850 63 kb   Silflow/Lefebvre                             12l2                                                                                                                                   26d1*                                                                                   33d17                                                                                                                        
VI DNAPH (CPH1 or CRY1) L07561 19 832     Silflow/Lefebvre none                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
VI TUG U31545 19 296 94 kb CNA9 contig Silflow/Lefebvre                                                               19l10             20m10                                 22k18                                             25m10           27f3 27f21                                           30 o12                                             34p2 34p3                   37j22           38h9 38l8*                                                                    
VI CNA9 BG843541 19 445 90 kb TUG contig Silflow/Lefebvre 10g2 10j16                 12e10 12h4                                                                       22c11                                                           25k1   26a17                                                                             32p2                                   36g17                     38h9 38l8*                     3j19*                                              
VI GAS3       97 kb GAS3 contig (97 kb) Silflow/Lefebvre               12d3                                                                                                               24b5 24c2         24f10* 24g21                     26i3*                               2a2                                                                                                                                                                          
VI RPS4 BG850189 9 1894   GAS3 contig (97 kb) Silflow/Lefebvre               12d3                                                                                                               24b5 24c2         24f10 24g21                     26i3                               2a2                                                                                                                                                                          
VI RPL41 AF130727 9 457 153 kb   Silflow/Lefebvre                                 13g13                                                                           22k7           23j23         24c10*                                                     28i23                           30l14               32g15                                                       37k2*                               3a13                                                
 

 

NOTE- BAC 25i16 is the most centromere-proximal BAC in the mating type locus.
BACs in parentheses represent the telomere-proximal end of the mating type locus.


Last updated on December 26, 2003
By Nancy Haas nancy-h@biosci.cbs.umn.edu

Back to list of linkage groups