Linkage Group XII/XIII

This table contains molecular mapping data from the Silflow-Lefebvre laboratory at the University of Minnesota.
Asterisks denote BAC clones at the end of a contig.

LG        PROBE        ACCESSION # v2.0 SCAFFOLD v1.0 SCAFFOLD CONTIG SIZE OVERLAP WITH SCREENED BY BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC BAC
XII/XIII GAPC L27669 115 890 77.5 kb   Silflow/Lefebvre       10k20     10n21                               13p16                                                   17n9                                                                                                                                                                                             30e20 30e21                                                                              
XII/XIII IDA1, PF9 U61364 115 108 154 kb IDA1/PF9 contig (154kb) Silflow/Lefebvre                                         13o15 13p15                       15j6                     17e12*                                         1n24                                     23g8*                                                           26n7                                               2n15                                                                                          
XII/XIII CNB20 AF486824 115 108   IDA1/PF9 contig (154kb) Silflow/Lefebvre                                                                                         17e12*                                                                                                                                                                                           2n15                                                                                          
XII/XIII CNC54 AF174532 74 809   IDA1/PF9 contig (154kb) Silflow/Lefebvre                                                                                         17e12*                                                                                                                                                                                           2n15                                                                                          
XII/XIII CNA10       90 kb   Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                                                                                                           30d10*                                                                                    
XII/XIII PSR1 AF174532 74 809 76 kb PSR1 contig (164kb) Silflow/Lefebvre                                                             15a8                                                           1b6                         21f6                                                                                                                                                                                                                            
XII/XIII IDA4 Z48059 74 809 139 kb PSR1 contig (164kb) Silflow/Lefebvre     10h5         11b9                                             15a8                                                           1b6                           21k12                                                                                                                                                                                   33n4                                      
XII/XIII LF2       123 kb PSR1 contig (164kb) Silflow/Lefebvre     10h5                             13g5                                                                                                                       22g4                                                     25h17                                                                                                     32a11                 33n4                                      
XII/XIII CNC8 BI873562 63 658 182.5 kb   Silflow/Lefebvre                                                                                 16j18         17j24                                                                 22h22                                 24h6       24j21*                                     27b5                   28k17           2c18*                                 31f10                                         34f7                 35g6    
XII/XIII CNC53 BE725171 49 144 136 kb GSK3 contig (162kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                   17p23*                                             21f3     21o2                                                 24n2*                                         27n12                                                                                       33n6           34c23         34j15              
XII/XIII GSK3 AV392622 49 147 162 kb CNC53 contig (136kb) Silflow/Lefebvre                                                                                                                 19j24*                               21f3*               22l20           23g19                     24i24     24n2                                                                                                                                           34c18                          
XII/XIII GP330       151 kb GP330 contig (202kb) Silflow/Lefebvre                                                   14j8   14o11         15f19                                           19g21                                                                                                       25m2*       26f7                             28h7                                                                                               34h17           34o24        
XII/XIII M63       151 kb GP330 contig (202kb) Silflow/Lefebvre                                                                 15f19                                           19g21                                                                                                       25m2*       26f7                             28h7                                                                                               34h17           34o24        
XII/XIII EYE2 AF233430 49 104 134 kb GP330 contig (202kb) Silflow/Lefebvre                                     13g10                   14o15                                                   19g21                                                                                               25a1*               26f7                                                                                                                                                  
XII/XIII CTH1 AF337037 49 1071 107 kb CTH1 contig (107 kb) Silflow/Lefebvre                                     13g10               14k1                                                               19p10                                                                                       25a1*     25l15                                               28l22       29m23             30b1                                                                                   35h16  
XII/XIII GP31   37     ODA6 contig (148kb) Silflow/Lefebvre                                                                         16e6                                 19c4                                                                                                                                                                                                     31f12                                                              
XII/XIII ODA6 X55382 37 173 148 kb ODA6 contig (148kb) Silflow/Lefebvre                                                           14p10             16e6                                                                                                                                     25a23                                                                                                 31f12                                                              
XII/XIII PTX4 (Pazour)         CTH1 contig (107 kb) Silflow/Lefebvre                                     13g10               14k1                                                                                                                 22o17           23p14                                                                                       29m23             30b1                                 32e4                                                   36c14*
XII/XIII SAC3 AF100162 101 141     Silflow/Lefebvre none                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
XII/XIII GP346D AY398642 16 1280 100 kb   Silflow/Lefebvre                                                                       16c14   16g5                                                                                                           24b22                                       26j5*               27b21                                             30e5     30g2                                                           34j10                
XII/XIII IC138   16 278 118 kb   Silflow/Lefebvre                                                                                     17c8                                                                                         23k17                                                                                         29i21                                               32d15                                                      
XII/XIII GP227 AY398643 16 725 122kb   Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     34l6          
XII/XIII GP399 AY398637 38, 129 2000,1400 123 kb   Silflow/Lefebvre   10g7                         12n18                                 15b3                               17l7*                                     20b19     20j7                       22m10             23o12         24e5                             26d20*         26l1                                               2m13   2p13                     31e23     31k3                         33n20                     34k1            
XII/XIII ODA12 U89649 38 15 96 kb   Silflow/Lefebvre                   11c15                   13j24                                           16p19                                                           21e18                                                     24j5                                                                                               30k9     30n8                                                                    
XII/XIII LC3 U43610 38 15 98 kb   Silflow/Lefebvre                     11i17 11l13                                                                               18g14           19k7                         21d1                                                             24n22               26d24               26p16                                                                                         33d7                                          
XII/XIII ALK AF199021 38 15 69 kb   Silflow/Lefebvre           10m20     11c7*                                                                     17c21*                                     1e24                                 22j19           23g14         24a5                                                 26o6                                                                 30l22                                                                      
XII/XIII GS2 U46208 38 15 144 kb   Silflow/Lefebvre                                                                                                                                       20b24                             22n13*                                                                                         28j5*     28o4                                                                           34b16                              
XII/XIII ODA9 U19120 96 472 79 kb   Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             32h19                                                  
XII/XIII 14-3-3 X79445 109 154 106 kb   Silflow/Lefebvre                                                                                                                                                                                                 24h8*                                                                                                                                                                              
XII/XIII LAO1 U78797 88 757 196 kb LAO1 contig (196kb) Silflow/Lefebvre         10m8                                                                                               18g24     19h24*                                         22f6                                                                                                   28i24                 2c23                       30l21                                       33p9             34i11           35f23      
XII/XIII OEE2 M15187 88 2104   LAO1 contig (196kb) Silflow/Lefebvre         10m8                 12c17                                         15l18         16i17                               19h24*                                                                                                                                                                 2i6                                   31m4                         33p9                                
XII/XIII CP26 AB050007 53 800,2104   LAO1 contig (196kb) Silflow/Lefebvre         10m8                 12c17                                         15l18         16i17                               19h24*                                                                                                                                                                 2i6                                                             33p9                                
XII/XIII EST 925006F07 BE441535 7 87   TUB2 Silflow/Lefebvre                                 13b16                                                                                         1e14   1g11 1h15                                                           24f4                                                       28a3 28b3 28f1                                                                       32o20                 34c17                            
XII/XIII TUB2 K03281 7 195 152 kb EST 925006F07 Silflow/Lefebvre                         12a12       13b16               14d1                           16g18                                         1a12                                                                     24f4*                                                   27k24                     29b4                                                                                                        
XII/XIII RDB BG858985 7 80 119 kb   Silflow/Lefebvre                               13b13                                                                     18c15                                   20i20*                                                                                                                                                                                     32m11*   33c11                                            
XII/XIII CNC63   7 853 166 kb CNC63 contig (166 kb) Silflow/Lefebvre                                               14a22                                                                                                                                                                       25o9                                                                                                                                                        
XII/XIII TUB1 M10064 7 853   CNC63 contig (166 kb) Silflow/Lefebvre                                               14a22                                             17k19                                                                                                                         25o9         26k14       26o10                                                                                             33f14                                        
XII/XIII EST 925007C10 BE441623 7 853   CNC63 contig (166 kb) Silflow/Lefebvre                                               14a22                                             17k19                                                                                           24e4                             25o9         26k14       26o10                                                                                             33f14                                        
This linkage group is continued on the next page


Last updated on December 26, 2003
By Nancy Haas nancy-h@biosci.cbs.umn.edu

Back to list of linkage groups